«Gift From God» es una novela visual contada desde la perspectiva de Ryosuke Nikaido y Akane Yamamoto. A medida que se enfrentan a tres misiones encomendadas por Dios, sus corazones, sus pasados y sus decisiones empiezan a entrelazarse, lo que les lleva a descubrir el verdadero significado del «regalo» de Dios.