«IncyanSpace» cuenta la historia de Li, un humano artificial, que se lanza a la búsqueda de Yuan, su hermano humano biológico, al que no ve desde hace mucho tiempo. Junto con los «Nuevos Humanos» que han sobrevivido, se enfrentan a Xystem, una fuerza dominante formada por formas de vida mecánicas que controla el mundo de la superficie.